Diakonia merupakan salah satu departemen yang menangani bidang pelayanan bagi orang sakit dan juga bagi jemaat-jemaat yang membutuhkan perhatian dalam bidang ekonomi, jasmani dan rohani. Setiap bulan, ada pelayanan Perjamuan Kudus bagi jemaat-jemaat yang sakit dan tidak bisa datang beribadah.

Ada beberapa jemat yang di support secara rutin setiap bulan, dan ada juga yang di support jika terkena musibah, bencana alam, dsb. Dan juga turut serta berbagi kasih kepada orang-orang yang bekerja di Thamrin City, secara khusus saat lebaran, dalam rangka menjalin kerjasama dan mempraktekkan kasih Kristus.